Desempenhos de RT salivar rápida e conectada

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Aug 22, 2023

Desempenhos de RT salivar rápida e conectada

Scientific Reports volume 12, Artigo número: 2843 (2022) Citar este artigo 2492 Acessos 8 Citações 10 Detalhes das Métricas Altmétricas No contexto da reabertura de eventos sociais e relançamento econômico,

Scientific Reports volume 12, Artigo número: 2843 (2022) Citar este artigo

2492 Acessos

8 citações

10 Altmétrico

Detalhes das métricas

No contexto da reabertura de eventos sociais e do relançamento económico, a vigilância sanitária da infeção por SARS-CoV-2 continua a ser necessária. Aqui, avaliamos o desempenho diagnóstico de um ensaio de amplificação isotérmica mediada por loop de transcrição reversa (RT-LAMP) rápido, livre de extração e conectado na saliva. Swabs nasofaríngeos (NP) e saliva de 443 pacientes ambulatoriais foram coletados simultaneamente e testados por PCR quantitativo com transcrição reversa (RT-qPCR) como teste padrão de referência. Setenta e um indivíduos (16,0%) foram positivos por NP e/ou RT-qPCR salivar. A sensibilidade e a especificidade do RT-LAMP salivar foram de 85,9% (IC95% 77,8–94,0%) e 99,5% (98,7–100%), respectivamente. Os desempenhos foram semelhantes para participantes sintomáticos e assintomáticos. Além disso, foram analisadas variantes genéticas do SARS-CoV-2 e nenhuma mutação dominante na região do iniciador RT-LAMP foi observada durante o período do estudo. Demonstramos que este teste RT-LAMP em saliva auto-coletada é confiável para detecção de SARS-CoV-2. Este teste simples e conectado com transferência automática opcional de resultados para as autoridades de saúde é único e abre o caminho para garantir eventos profissionais e sociais no contexto real do reinício da economia.

A pandemia da doença coronavírus 2019 (COVID-19) exige um diagnóstico rápido, preciso e escalonável para evitar a propagação da doença e reabrir a sociedade com segurança. A reação em cadeia da polimerase quantitativa de transcrição reversa (RT-qPCR) e a detecção de antígeno são os principais métodos diagnósticos empregados para o diagnóstico da infecção por coronavírus 2 da síndrome respiratória aguda grave (SARS-CoV-2), sendo o RT-qPCR o padrão ouro validado. Este ensaio requer instrumentação especializada e cara, pessoal treinado e reagentes com fornecimento limitado. O RT-qPCR requer extração de RNA, que é uma etapa demorada e normalmente retorna resultados 24 horas após a coleta da amostra.

RT-LAMP (amplificação isotérmica mediada por loop de transcrição reversa) é uma tecnologia rápida e portátil que não requer analistas altamente qualificados nem instrumentos especializados (normalmente apenas uma fonte de calor é necessária), tornando esta tecnologia uma alternativa ao RT-qPCR.

Os swabs nasofaríngeos (NP) e orofaríngeos (OP) são as amostras mais comumente utilizadas para o diagnóstico da infecção por SARS-CoV-2. A amostragem de esfregaços NP e OP é invasiva, dolorosa e expõe os profissionais de saúde à contaminação1. Em contraste, a auto-amostragem de saliva é fácil, não invasiva e particularmente adequada para testes em crianças e idosos. Além disso, a coleta de saliva dispensa materiais especializados e dispensa o uso de equipamentos de proteção individual, economizando tempo e custos. A amostragem de saliva sendo bem aceita2,3, é uma amostra adequada para testes em massa e domiciliares.

Da mesma forma, o SARS-CoV-2 foi detectado em altas cargas na saliva de indivíduos sintomáticos e assintomáticos e também demonstrou infectar células-alvo4,5,6,7,8,9,10,11. Estudos comparando saliva e NPS por meio do teste de amplificação de ácidos nucleicos (NAAT) mostraram sensibilidades variando de 69,2 a 100%5,6,8,12,13. Uma meta-análise recente sugeriu que as precisões diagnósticas da saliva e do NPS NAAT são semelhantes14.

A situação sanitária mundial da COVID-19 permanece heterogénea, principalmente devido a diversas políticas, recursos e estratégias de vacinação antipandémicas15. Para os próximos meses a estratégia de reabertura e relançamento de eventos sociais e profissionais será central. Além do monitoramento da pandemia de médio/longo prazo, a população testada ainda é importante, uma vez que a imunidade da vacina e a imunidade natural são imperfeitas e o distanciamento social é mais flexibilizado16. Para este efeito, a par das abordagens de vigilância colectiva (por exemplo, testes de vírus nos esgotos), as autoridades procuram sistemas de testes individuais com maior aceitabilidade e eficiência da população. Portanto, as especificações ideais de testes de vírus individuais são: (1) Amostragem simples e indolor para evitar qualquer relutância da população em testes recorrentes, (2) Fácil, rápida e de baixo custo para torná-la utilizável em grande escala e em qualquer condição, inclusive sem laboratórios e conhecimentos especializados, (3) Sensíveis e específicos para trazer segurança e (4) Estar conectados em tempo real para permitir informações individuais imediatas, bem como monitoramento por autoridades locais ou nacionais17. Este último ponto é fundamental para garantir que eventos ou plantas profissionais retornem às atividades. O desenvolvimento de um RT-LAMP salivar rápido que cumpra a maioria destes pontos para a detecção do SARS-CoV-2 seria um passo em frente na implementação de um teste no local de atendimento para reabrir as economias com segurança e prevenir futuros surtos.

 C) and AY.34 (major mutation 26109G > A) and the VOIs B.1.621 and its descendent lineage B.1.621.1 (26158_26161del) presented a prevalence of 6.1%, 0.3% and 0.2%, respectively, of all sequenced specimens over the world and sampled between July to October 2021 (updated on November 10th 2021)./p>